2017 Bertha, M., A. Vasantharoopan, A. Kumar, B. B. Bruce, J. Prince, T. Hofmekler, D. Okou, P. Chopra, G. Wang, C. Sauer, C. J. Landers, S. Z. Hussain, R. K. Cross, R. N. Baldassano, M. D. Kappelman, J. Katz, J. S. Alexander, B. S. Kirschner, D. E. Moulton, B. O. Osuntokun, A. Patel, S. Saeed, J. A. Klapproth, T. A. Dhere, M. C. Dubinsky, D. McGovern and S. Kugathasan (2017). "IBD Serology and Disease Outcomes in African Americans With Crohn's Disease." Inflamm Bowel Dis 24(1): 209-216. Marigorta, U. M., L. A. Denson, J. S. Hyams, K. Mondal, J. Prince, T. D. Walters, A. Griffiths, J. D. Noe, W. V. Crandall, J. R. Rosh, D. R. Mack, R. Kellermayer, M. B. Heyman, S. S. Baker, M. C. Stephens, R. N. Baldassano, J. F. Markowitz, M. O. Kim, M. C. Dubinsky, J. Cho, B. J. Aronow, S. Kugathasan and G. Gibson (2017). "Transcriptional risk scores link GWAS to eQTLs and predict complications in Crohn's disease." Nat Genet 49(10): 1517-1521. Syed, S., E. S. Michalski, V. Tangpricha, S. Chesdachai, A. Kumar, J. Prince, T. R. Ziegler, P. S. Suchdev and S. Kugathasan (2017). "Vitamin D Status Is Associated with Hepcidin and Hemoglobin Concentrations in Children with Inflammatory Bowel Disease." Inflamm Bowel Dis 23(9): 1650-1658. Kugathasan, S., L. A. Denson, T. D. Walters, M. O. Kim, U. M. Marigorta, M. Schirmer, K. Mondal, C. Liu, A. Griffiths, J. D. Noe, W. V. Crandall, S. Snapper, S. Rabizadeh, J. R. Rosh, J. M. Shapiro, S. Guthery, D. R. Mack, R. Kellermayer, M. D. Kappelman, S. Steiner, D. E. Moulton, D. Keljo, S. Cohen, M. Oliva-Hemker, M. B. Heyman, A. R. Otley, S. S. Baker, J. S. Evans, B. S. Kirschner, A. S. Patel, D. Ziring, B. C. Trapnell, F. A. Sylvester, M. C. Stephens, R. N. Baldassano, J. F. Markowitz, J. Cho, R. J. Xavier, C. Huttenhower, B. J. Aronow, G. Gibson, J. S. Hyams and M. C. Dubinsky (2017). "Prediction of complicated disease course for children newly diagnosed with Crohn's disease: a multicentre inception cohort study." Lancet. Brant, S. R., D. T. Okou, C. L. Simpson, D. J. Cutler, T. Haritunians, J. P. Bradfield, P. Chopra, J. Prince, F. Begum, A. Kumar, C. Huang, S. Venkateswaran, L. W. Datta, Z. Wei, K. Thomas, L. J. Herrinton, J. A. Klapproth, A. J. Quiros, J. Seminerio, Z. Liu, J. S. Alexander, R. N. Baldassano, S. Dudley-Brown, R. K. Cross, T. Dassopoulos, L. A. Denson, T. A. Dhere, G. W. Dryden, J. S. Hanson, J. K. Hou, S. Z. Hussain, J. S. Hyams, K. L. Isaacs, H. Kader, M. D. Kappelman, J. Katz, R. Kellermayer, B. S. Kirschner, J. F. Kuemmerle, J. H. Kwon, M. Lazarev, E. Li, D. Mack, P. Mannon, D. E. Moulton, R. D. Newberry, B. O. Osuntokun, A. S. Patel, S. A. Saeed, S. R. Targan, J. F. Valentine, M. H. Wang, M. Zonca, J. D. Rioux, R. H. Duerr, M. S. Silverberg, J. H. Cho, H. Hakonarson, M. E. Zwick, D. P. McGovern and S. Kugathasan (2017). "Genome-Wide Association Study Identifies African-Specific Susceptibility Loci in African Americans With Inflammatory Bowel Disease." Gastroenterology 152(1): 206-217 e202. Chandrakasan, S., S. Venkateswaran and S. Kugathasan (2017). "Nonclassic Inflammatory Bowel Disease in Young Infants: Immune Dysregulation, Polyendocrinopathy, Enteropathy, X-Linked Syndrome, and Other Disorders." Pediatr Clin North Am 64(1): 139-160. 2016 Shaw, K. A., M. Bertha, T. Hofmekler, P. Chopra, T. Vatanen, A. Srivatsa, J. Prince, A. Kumar, C. Sauer, M. E. Zwick, G. A. Satten, A. D. Kostic, J. G. Mulle, R. J. Xavier, and S. Kugathasan. 2016. 'Dysbiosis, inflammation, and response to treatment: a longitudinal study of pediatric subjects with newly diagnosed inflammatory bowel disease', Genome Med, 8: 75. Dhere, T., I. Copland, M. Garcia, K. Y. Chiang, R. Chinnadurai, M. Prasad, J. Galipeau, and S. Kugathasan. 2016. 'The safety of autologous and metabolically fit bone marrow mesenchymal stromal cells in medically refractory Crohn's disease - a phase 1 trial with three doses', Aliment Pharmacol Ther, 44: 471-81. Palle, S. K., M. Prasad and S. Kugathasan (2016). "Approach to a Child with Colitis." Indian J Pediatr. Manyapu, M., G. J. Warraich, S. Kugathasan and S. Syed (2016). "2-Year-Old with a Limp and Suspected Non-Accidental Injury." J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2015 Huang, C., T. Haritunians, D. T. Okou, D. J. Cutler, M. E. Zwick, K. D. Taylor, L. W. Datta, J. C. Maranville, Z. Liu, S. Ellis, P. Chopra, J. S. Alexander, R. N. Baldassano, R. K. Cross, T. Dassopoulos, T. A. Dhere, R. H. Duerr, J. S. Hanson, J. K. Hou, S. Z. Hussain, K. L. Isaacs, K. E. Kachelries, H. Kader, M. D. Kappelman, J. Katz, R. Kellermayer, B. S. Kirschner, J. F. Kuemmerle, A. Kumar, J. H. Kwon, M. Lazarev, P. Mannon, D. E. Moulton, B. O. Osuntokun, A. Patel, J. D. Rioux, J. I. Rotter, S. Saeed, E. J. Scherl, M. S. Silverberg, A. Silverman, S. R. Targan, J. F. Valentine, M. H. Wang, C. L. Simpson, S. L. Bridges, R. P. Kimberly, S. S. Rich, J. H. Cho, A. Di Rienzo, L. W. Kao, D. P. McGovern, S. R. Brant and S. Kugathasan (2015). "Characterization of genetic loci that affect susceptibility to inflammatory bowel diseases in African Americans." Gastroenterology 149(6): 1575-1586. Cutler, D. J., M. E. Zwick, D. T. Okou, S. Prahalad, T. Walters, S. L. Guthery, M. Dubinsky, R. Baldassano, W. V. Crandall, J. Rosh, J. Markowitz, M. Stephens, R. Kellermayer, M. Pfefferkorn, M. B. Heyman, N. LeLeiko, D. Mack, D. Moulton, M. D. Kappelman, A. Kumar, J. Prince, P. Bose, K. Mondal, D. Ramachandran, J. F. Bohnsack, A. M. Griffiths, Y. Haberman, J. Essers, S. D. Thompson, B. Aronow, D. J. Keljo, J. S. Hyams, L. A. Denson, P.-K. R. Group and S. Kugathasan (2015). "Dissecting Allele Architecture of Early Onset IBD Using High-Density Genotyping." PLoS One 10(6): e0128074. Natarajan, B., C. Sauer, B. Shehata and S. Kugathasan (2015). "Hidradenitis suppurativa and pediatric Crohn disease." J Pediatr Gastroenterol Nutr 60(4): e29-30. 2014 Gevers, D., S. Kugathasan, L. A. Denson, Y. Vazquez-Baeza, W. Van Treuren, B. Ren, E. Schwager, D. Knights, S. J. Song, M. Yassour, X. C. Morgan, A. D. Kostic, C. Luo, A. Gonzalez, D. McDonald, Y. Haberman, T. Walters, S. Baker, J. Rosh, M. Stephens, M. Heyman, J. Markowitz, R. Baldassano, A. Griffiths, F. Sylvester, D. Mack, S. Kim, W. Crandall, J. Hyams, C. Huttenhower, R. Knight and R. J. Xavier (2014). "The treatment-naive microbiome in new-onset Crohn's disease." Cell Host Microbe 15(3): 382-392. Okou, D. T., K. Mondal, W. A. Faubion, L. J. Kobrynski, L. A. Denson, J. G. Mulle, D. Ramachandran, Y. Xiong, P. Svingen, V. Patel, P. Bose, J. P. Waters, S. Prahalad, D. J. Cutler, M. E. Zwick and S. Kugathasan (2014). "Exome sequencing identifies a novel FOXP3 mutation in a 2-generation family with inflammatory bowel disease." J Pediatr Gastroenterol Nutr 58(5): 561-568. Okou, D. T., and S. Kugathasan. 2014. 'Role of genetics in pediatric inflammatory bowel disease', Inflamm Bowel Dis, 20: 1878-84. 2013 Middleton, J. P., A. P. Bhagavathula, B. Gaye, J. A. Alvarez, C. S. Huang, C. G. Sauer, G. Tenjarla, B. T. Schoen, A. Kumar, M. Prasad, D. T. Okou, W. C. Ifeadike, T. A. Dhere, K. N. Conneely, T. R. Ziegler, V. Tangpricha and S. Kugathasan (2013). "Vitamin D status and bone mineral density in African American children with Crohn disease." J Pediatr Gastroenterol Nutr 57(5): 587-593. Waters, J., V. Dhere, A. Benjamin, A. Sekar, A. Kumar, S. Prahalad, D. T. Okou and S. Kugathasan (2013). "A practical and novel method to extract genomic DNA from blood collection kits for plasma protein preservation." J Vis Exp(75): e4241.